Rada Naukowa CTK jest organem inicjującym i opiniodawczym Centrum.
Członków Rady CTK powołuje Rektor.
W jej skład wchodzą pracownicy AGH oraz upoważnieni przedstawiciele innych jednostek naukowo-badawczych, przemysłowych, zarówno krajowych, jak i międzynarodowych.
Rada CTK jest upoważniona do zajmowania stanowiska we wszystkich sprawach dotyczących CTK, a do jej zadań należy m.in. wyznaczanie kierunków działalności naukowej, rozwojowej i wdrożeniowej CTK.